Tesla Bio Workbench

LAMMPS su GPU Tesla

 

LAMMPS è un classico pacchetto di dinamica molecolare programmato per un'esecuzione ottimale su macchine di elaborazione in parallelo. La versione CUDA di LAMMPS è accelerata grazie al trasferimento dei calcoli di forza sulla GPU.

Download e installazione

  • GPU LAMMPS
    • Il codice per GPU di LAMMPS usufruisce dell'abilitazione MPI e consente la scalabilità su un cluster GPU di grandi dimensioni

Dati di riferimento

LAMMPS sulla GPU è scalabile in modo ottimale come evidenziato dai dati riportati qui sotto. Due GPU Tesla che eseguono LAMMPS surclassano configurazioni da 24 CPU.

LAMMPS Results on CPU vs GPU Clusters
I dati sono cortesemente offerti da Scott Hampton e Pratul K. Agarwal,Oak Ridge National Laboratory

Documenti tecnici e presentazioni

Forum di discussione

Soluzioni GPU

Le applicazioni Tesla Bio Workbench possono essere implementate su personal supercomputer desktop basati su GPU o in soluzioni data center. Basate sulla rivoluzionaria architettura di elaborazione in parallelo CUDA, queste soluzioni sono progettate per accelerare il ritmo delle ricerche scientifiche computazionali.

CONFIGURAZIONE HARDWARE CONSIGLIATA

Configurazione per workstation desktop Configurazione per data center
  • GPU
    • 4 GPU Tesla C1060
  • CPU e memoria principale
    • CPU x86 a 2,33 GHz
    • >16GB (4 GB di memoria principale per ogni GPU Tesla C1060)
  • GPU per nodo
    • Tesla S1070 (con 4 GPU in un rack 1U) o server ibridi con GPU M1060
  • CPU e memoria principale
    • CPU x86 a 2,33 GHz per ogni server
    • 16 GB per server

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